Соответствующие изменения в порядок определения доходов и расходов при определении налоговой базы по налогам, уплачиваемым в связи с применением ЕСХН и УСН, внесены Федеральным законом от 06.04.2015 № 84-ФЗ «О внесении изменений в часть вторую Налогового кодекса Российской Федерации».
При этом, уплаченные суммы НДС не будут включаться в расходы при исчислении ЕСХН и налога, уплачиваемого в связи с применением УСН.
Данные изменения внесены в целях устранения двойного налогообложения.
По действующему порядку сумма НДС, указанная в счете-фактуре, выставленном лицами, не являющимися налогоплательщиками НДС, подлежит уплате в бюджет, и эта же сумма включается в доходы от реализации и облагается налогом, уплачиваемым в связи с применением ЕСХН (УСН).
Кроме того, с 1 января 2016 года снимается ограничение на применение УСН для организаций, имеющих представительства.